Crédit d’impôt recherche pour les éditeurs de logiciels logistiques : CIR, CII et rattrapage sur 3 ans
Quels travaux sont éligibles, combien ils rapportent et comment récupérer le crédit des trois dernières années : le CIR et le CII appliqués à la réalité du secteur, chiffres à l’appui.
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Mis à jour le 16 octobre 2026Lecture 6 minExemple chiffré 2026
Les éditeurs de logiciels logistiques résolvent des problèmes d’optimisation parmi les plus difficiles de l’informatique : tournées, entreposage, prévision de la demande. Leurs moteurs d’optimisation, souvent développés sur des années, concentrent l’essentiel de leurs travaux de recherche.

- Taux du CIR
- 30 %
- CIR / an (exemple)
- 97 305 €
- CII / an (exemple)
- 7 100 €
- Rattrapage 3 ans
- 313 215 €
Le CIR pour les éditeurs de logiciels logistiques : un levier sous-utilisé
Pour une entreprise du secteur, la question n’est pas de savoir si elle « fait de la recherche » au sens académique, mais si certains de ses projets ont dû affronter un problème technique sans solution connue. Dès que c’est le cas, la phase correspondante ouvre droit au crédit d’impôt recherche, quel que soit le diplôme des personnes qui l’ont menée.
Les équipes associent chercheurs opérationnels, data scientists et développeurs. Leurs salaires chargés, majorés du forfait de fonctionnement de 40 %, forment l’essentiel de la base du crédit.
Les travaux éligibles au CIR pour les éditeurs de logiciels logistiques
Les projets suivants présentent, dans le secteur, les caractéristiques de la recherche au sens fiscal :
- Concevoir des algorithmes d’optimisation de tournées sous contraintes en temps réel.
- Développer des modèles de prévision de la demande pour des produits à faible historique.
- Mettre au point des méthodes de pilotage d’entrepôts automatisés.
- Créer des jumeaux numériques de chaînes logistiques.
Ces exemples ont un point commun : un verrou technique, c’est-à-dire une difficulté que l’état de l’art ne permettait pas de résoudre au début des travaux. C’est ce verrou, documenté et daté, qui fonde le crédit, et c’est lui que l’expert du ministère de la Recherche examine en premier. Le guide travaux éligibles au CIR détaille les cinq critères appliqués par l’administration.
Ce qui n’est pas de la recherche
À l’inverse, certaines activités du secteur, pourtant techniques, ne relèvent pas de la recherche au sens fiscal :
- Le paramétrage chez les clients.
- Les interfaces avec les systèmes de gestion.
- Le développement de fonctionnalités courantes.
Un même projet comporte souvent une phase de recherche et des phases qui n’en relèvent pas. Bien les découper, en datant le début et la fin de chacune et en n’y rattachant que les temps correspondants, est la meilleure protection en cas de contrôle.
Combien rapporte le CIR pour les éditeurs de logiciels logistiques ?
Pour fixer les ordres de grandeur, voici le calcul complet pour une entreprise représentative du secteur, avec les taux et forfaits de 2026.
Un éditeur logistique de 40 salariés affecte cinq ingénieurs, payés 55 000 € brut en moyenne, à la moitié de leur temps à son moteur d’optimisation, et finance 30 000 € de travaux universitaires. Un développeur conçoit un nouveau module au titre du CII.
| Étape du calcul | Montant |
|---|---|
| Dépenses de personnel : 5 personnes à 55 000 € brut, charges comprises, 50 % du temps | 195 250 € |
| Dotations aux amortissements du matériel de recherche | 12 000 € |
| Forfait de fonctionnement : 40 % du personnel et 75 % des amortissements | 87 100 € |
| Sous-traitance à des organismes agréés ou publics | 30 000 € |
| Subventions reçues pour ces travaux, déduites | 0 € |
| Base du crédit d’impôt recherche | 324 350 € |
| Crédit d’impôt recherche à 30 % | 97 305 € |
| Dépenses d’innovation (prototypes, CII) | 35 500 € |
| Crédit d’impôt innovation à 20 % | 7 100 € |
| Total des crédits d’impôt sur l’année | 104 405 € |
| Rattrapage possible sur les 3 dernières années, à dépenses comparables | 313 215 € |
L’entreprise obtient 97 305 € de crédit d’impôt recherche et 7 100 € de crédit d’impôt innovation, soit 104 405 € par an. Pour une PME, ce montant est remboursé immédiatement si l’entreprise n’a pas d’impôt à payer. L’effet de la taille de l’équipe est direct :
| Scénario | Effectif de recherche | CIR par an | Rattrapage sur 3 ans |
|---|---|---|---|
| Équipe deux fois plus petite | 3 personnes | 64 503 € | 193 509 € |
| Équipe de l’exemple | 5 personnes | 97 305 € | 291 915 € |
| Équipe deux fois plus grande | 10 personnes | 179 310 € | 537 930 € |
Faites le calcul avec votre propre équipe :
Récupérez le CIR des 3 dernières années
Le crédit d’impôt recherche se rattrape. Une entreprise qui n’a jamais déclaré ses travaux peut encore demander le crédit des années 2023, 2024 et 2025, soit environ 313 215 € à dépenses comparables à celles de l’exemple.
| Dépenses de l’année | Déclaration normale | Réclamation jusqu’au | Crédit à dépenses comparables |
|---|---|---|---|
| 2023 | mai 2024 | 31 décembre 2026 | 104 405 € |
| 2024 | mai 2025 | 31 décembre 2027 | 104 405 € |
| 2025 | mai 2026 | 31 décembre 2028 | 104 405 € |
Chaque 31 décembre, une année sort du délai : les dépenses de 2023 ne pourront plus être réclamées après le 31 décembre 2026. Les années antérieures au 15 février 2025 bénéficient en outre d’un forfait de fonctionnement de 43 % et, pour le CII, d’un taux de 30 %, plus favorable que les règles actuelles. Voir CIR rétroactif.
Le crédit d’impôt innovation dans le secteur
Le crédit d’impôt innovation est particulièrement adapté pour les éditeurs de logiciels logistiques. Il finance, à 20 %, la conception de prototypes ou d’installations pilotes de produits nouveaux plus performants que ceux du marché, même lorsque les techniques employées sont connues. Il est réservé aux PME et plafonné à 400 000 € de dépenses par an.
Dans l’exemple de cette page, 35 500 € de dépenses de conception donnent 7 100 € de CII par an. Une même dépense ne peut pas figurer à la fois dans la base du CIR et dans celle du CII : les temps doivent être ventilés projet par projet. Voir le crédit d’impôt innovation et CIR ou CII.
Les pièges du CIR pour les éditeurs de logiciels logistiques
Avant de déclarer, vérifiez que votre dossier évite ces écueils fréquents dans le secteur :
- Inclure les projets de paramétrage client.
- Revendiquer l’usage de solveurs du marché.
- Ne pas documenter les benchmarks.
Les preuves à réunir
Un dossier justificatif solide repose sur des traces produites pendant les travaux. Dans le secteur, les plus probantes sont :
- Les benchmarks sur jeux de données de référence ;
- Les publications et collaborations académiques ;
- Les historiques de développement du moteur.
À ces pièces s’ajoutent, comme pour toute entreprise, les feuilles de temps par projet, les éléments de paie, le tableau des immobilisations affectées à la recherche, les contrats de sous-traitance avec la preuve de l’agrément des prestataires, et la liste des aides reçues. Le guide dossier justificatif donne le plan attendu.
Après le CIR : l’IP box sur vos revenus
Les licences du logiciel et de son moteur d’optimisation peuvent relever de l’IP box. Le CIR et l’IP box se cumulent : le premier porte sur les dépenses de recherche, le second sur les revenus de l’actif qui en est issu. Et l’IP box ne suppose pas d’avoir déclaré du CIR : une entreprise du secteur peut en bénéficier dès lors qu’elle exploite un actif éligible issu de ses propres travaux. Voir l’IP box pour les éditeurs de logiciels logistiques et cumuler CIR et IP box.
Se faire accompagner
L’accompagnement d’un spécialiste sécurise surtout la qualification des travaux, qui est l’étape décisive. Il permet aussi de mener ensemble le CIR, le CII et, lorsque l’entreprise exploite un brevet ou un logiciel, l’IP box.
- Diagnostic : un échange avec vos équipes techniques pour repérer les projets éligibles des trois dernières années et de l’année en cours.
- Chiffrage : calcul du CIR et du CII, année par année, avec les règles applicables à chacune.
- Dossier : rédaction du dossier justificatif et reconstitution des temps.
- Déclaration : dépôt des formulaires 2069-A-SD et, pour les années passées, des réclamations.
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Questions fréquentes
L’optimisation de tournées est-elle de la recherche ?
Lorsqu’elle vise des performances ou des contraintes que les méthodes publiées et solveurs du marché ne permettent pas d’atteindre, oui.
Les projets chez les clients sont-ils éligibles ?
Le paramétrage et l’intégration ne le sont pas.
Combien rapporte le CIR pour les éditeurs de logiciels logistiques ?
Dans l’exemple de cette page, 97 305 € par an de CIR et 7 100 € de CII, pour 5 personnes consacrant 50 % de leur temps aux travaux. Le crédit représente environ 42 % du coût salarial chargé consacré à la recherche.
Peut-on récupérer le CIR des années passées ?
Oui. Les dépenses non déclarées des années 2023, 2024 et 2025 peuvent encore être réclamées ; celles de 2023 jusqu’au 31 décembre 2026. Sur l’exemple de cette page, l’enjeu est d’environ 313 215 €.
Faut-il des docteurs pour avoir droit au CIR ?
Non. Les ingénieurs et techniciens qui conduisent des travaux de recherche ouvrent droit au crédit, quel que soit leur diplôme.